當種子完全干燥后，將其放入密封的容器中，如玻璃瓶、塑料瓶或密封袋等。容器要確保干凈、無水分，以防止種子受潮變質。在密封容器之前，可以在種子中放入一些干燥劑，如硅膠干燥劑，以吸收容器內的潮氣，保持種子的干燥環境。

將密封好的種子放置在陰涼、干燥的地方儲存，避免陽光直射和高溫環境。儲存溫度最好控制在 10-20℃之間，相對濕度保持在 30%-50% 左右。在這樣的儲存條件下，芭樂種子可以保存較長時間，一般可保存 6-12 個月左右。

對于需要長期保存的芭樂種子，可以采用低溫儲存的方法。將干燥后的種子放入密封容器中，然后放入冰箱的冷藏室或冷凍室中進行儲存。

冷藏室的溫度一般控制在 2-8℃之間，在這種溫度下，種子的代謝活動會減緩，從而延長種子的保存時間。如果需要更長時間的保存，可以將種子放入冷凍室中，冷凍室的溫度一般在 - 18℃以下。但在冷凍儲存前，要確保種子的干燥程度和密封狀態良好，以防止種子在低溫下受到凍害或受潮。

在低溫儲存過程中，要盡量避免頻繁地打開儲存容器，以免影響種子的儲存環境穩定性。當需要使用種子時，可以將其從冰箱中取出，在室溫下緩慢解凍，避免直接暴露在高溫環境中，以免影響種子的發芽率和活力。